Τη διενέργεια της έρευνας ανέθσε ο κ. Πεπονής στον Σπ. Μουζακίτη για να ερευνήσει το ζήτημα της μεταβίβασης υγιούς τμήματος της ΑΤΕ στον Όμιλο Πειραιώς αλλά και τους ισχυρισμούς του κ. Προβόπουλουπερί άστοχων ενεργειών με αγορές παραγώγων και άλλων «τοξικών» επενδυτικών προϊόντων που οδήγησαν σταδιακά σε κακή οικονομική θέση την τράπεζα. Στόχος της έρευνας είναι να διαπιστωθεί αν διαπράχθηκαν αδικήματα που να αφορούν την υποβάθμιση της θέσης της. 

Ο διοικητής της Τράπεζας της Ελλάδος υποστήριξε στην Επιτροπή Οικονομικών Υποθέσεων ότι η δεινή θέση της τράπεζας δεν οφείλεται μόνο στο «κούρεμα» των ομολόγων (PSI) αλλά σε χρόνια δομικά προβλήματα, αναφέροντας ότι τα κέρδη της στην περίοδο 1997-2010 μόλις φθάνουν τα 190 εκατ. ευρώ παρά τις «κεφαλαιακές ενέσεις» ύψους 4 δισ. ευρώ. Ο ίδιος έκανε λόγο ακόμη για αστοχίες γιατί όπως είπε η ΑΤΕ τα προηγούμενα χρόνια επένδυσε 1,2 δισ. ευρω σε θυγατρικές εταιρείες από τα οποία ύστερα από απομειώσεις και διαγραφές έχουν απομεινει τα 156 εκατ. ευρώ. Επιπλέον η τράπεζα επένδυσε σε παράγωγα και τοξικά επενδυτικά προϊόντα με αποτέλεσμα να επιβαρυνθεί με ζημιές 285 εκατ. ευρω την τριετία 2009-2011.