Γεννημένος στο Βαλτοτόπι του Κιλκίς, στις 29 Αυγούστου του 1963, ο Μολακίδης αγωνίστηκε σε Κιλκισιακό, Απόλλωνα, Ολυμπιακό και Πανσερραϊκό.
Μετά το τέλος της αγωνιστικής διαδρομής του ασχολήθηκε με την εκγύμναση τερματοφυλάκων και μάλιστα για οκτώ χρόνια, από το 2006 έως το περασμένο καλοκαίρι, συνεργάστηκε με την ΕΠΟ, ως προπονητής τερματοφυλάκων όλων των «μικρών» εθνικών ομάδων.
Το θάνατο του Παναγιώτη Μολακίδη ανακοίνωσε η ΕΠΟ, εκφράζοντας τη βαθιά θλίψη της και τα συλλυπητήριά της προς την οικογένειά του.
Έφυγε σε ηλικία 51 ετών ο παλαίμαχος τερματοφύλακας Παναγιώτης Μολακίδης
Απεβίωσε σε ηλικία μόλις 51 ετών ο παλαίμαχος τερματοφύλακας, Παναγιώτης Μολακίδης, βασικός γκολκίπερ στην εξαιρετική εθνική ομάδα ελπίδων του 1988 (συμπαίκτης με Νίκο Νιόπλια, Αρη Καρασαββίδη και άλλους), η οποία έφτασε ως τον τελικό του αντίστοιχου Ευρωπαϊκού Πρωταθλήματος, χάνοντας τον τίτλο από τη Γαλλία του Ερίκ Καντονά και του Λοράν Μπλαν.
