Τα τελευταία τρία χρόνια, ο Καταλανός τεχνικός έδινε «μάχη» για να καταπολεμήσει την επάρατη νόσο και παρά το γεγονός πως πριν κάποιους μήνες υπήρχαν ενθαρρυντικά μηνύματα για την κατάστασή του, τελικά ήρθε το μοιραίο.
Ο Βιλανόβα είχε διαδεχθεί τον Πεπ Γκουαρντιόλα στον πάγκο της καταλανικής ομάδας (2012), αναλαμβάνοντας τους «μπλαουγκράνα» στην πιο επιτυχημένη στιγμή της ιστορίας τους, καθώς είχαν κερδίσει τους τρεις από τους τελευταίους τέσσερις τίτλους στην Primera Division και δύο Champions League (2009, 2011).
Υπό τις οδηγίες του Βιλανόβα η Μπαρτσελόνα ξεκίνησε στο πρωτάθλημα με 18 νίκες σε 19 αγώνες, αλλά τον Δεκέμβριο του 2012 διαγνώστηκε με καρκίνο, για δεύτερη φορά.
Ο Ισπανός τεχνικός υποβλήθηκε σε νέα επέμβαση αφήνοντας το «τιμόνι» στον βοηθό του, Ζόρντι Ρόουρα, αλλά στο τέλος της περιόδου ανακοίνωσε την παραίτησή του για να επικεντρωθεί στην επανάκαμψή του από την ασθένεια.